Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms