Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phox2aQ62066 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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