Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms