Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EsrrbQ61539 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms