Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PcolceQ61398 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PcolceQ61398 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PcolceQ61398 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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