Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ift88Q61371 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms