Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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BcanQ61361 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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BcanQ61361 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BcanQ61361 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BcanQ61361 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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BcanQ61361 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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BcanQ61361 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BcanQ61361 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BcanQ61361 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BcanQ61361 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BcanQ61361 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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BcanQ61361 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BcanQ61361 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms