Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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