Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms