Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms