Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Xrcc1Q60596 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Xrcc1Q60596 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Xrcc1Q60596 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Xrcc1Q60596 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Xrcc1Q60596 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc1Q60596 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc1Q60596 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Xrcc1Q60596 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Xrcc1Q60596 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms