Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms