Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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