Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ankrd28Q505D1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms