Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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