Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shank3Q4ACU6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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