Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc110Q3V125 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms