Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbof1Q3V079 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbof1Q3V079 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms