Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm12888Q3UW77 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm12888Q3UW77 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm12888Q3UW77 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm12888Q3UW77 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm12888Q3UW77 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm12888Q3UW77 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Gm12888Q3UW77 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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