Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fcho2Q3UQN2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcho2Q3UQN2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms