Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms