Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q3UPC7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3UPC7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms