Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms