Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf180Q3U827 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms