Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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