Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms