Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Kdm4dQ3U2K5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Kdm4dQ3U2K5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Kdm4dQ3U2K5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms