Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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