Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ccndbp1Q3TVC7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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