Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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