Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afvQ3THW5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms