Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms