Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb38Q3LR78 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms