Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptcd3Q14C51 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms