Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp2b3Q0VF55 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms