Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab42Q0PD08 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms