Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms