Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf541Q0GGX2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms