Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms