Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pou6f1Q07916 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms