Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cntn3Q07409 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms