Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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Igsf9Q05BQ1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Igsf9Q05BQ1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Igsf9Q05BQ1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Igsf9Q05BQ1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Igsf9Q05BQ1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Igsf9Q05BQ1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Igsf9Q05BQ1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Igsf9Q05BQ1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Igsf9Q05BQ1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Igsf9Q05BQ1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Igsf9Q05BQ1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Igsf9Q05BQ1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Igsf9Q05BQ1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Igsf9Q05BQ1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Igsf9Q05BQ1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Igsf9Q05BQ1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Igsf9Q05BQ1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Igsf9Q05BQ1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Igsf9Q05BQ1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms