Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms