Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a1Q04857 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a1Q04857 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms