Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Crisp3Q03402 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms