Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col6a2Q02788 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col6a2Q02788 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms