Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms