Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms