Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apoa1Q00623 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms