Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Bop1P97452 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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